Chuyện phim Chị trợ lý của anh xoay quanh Khả Doanh - một nữ doanh nhân tài năng, quyết đoán, nhưng đồng thời lạnh lùng khi sẵn sàng thẳng tay đuổi cổ nhân viên nếu thấy không vừa ý. Khi công ty sữa của gia đình đứng trước nguy cơ bị tập đoàn nước ngoài thu mua, cô đành phải tìm đến một cổ đông lớn là ông Chính để nhờ giúp đỡ. Tại đây, Doanh được ông “nhờ vả” tìm giúp bạn gái cho đứa cháu trai đích tôn là Phúc Nam. Hết cách, Doanh đành thi vào làm trợ lý cho chàng giám đốc kém tuổi để dễ bề hành động