Jean Grey lúc này đã khám phá ra sức mạnh của bản thân và trở thành Phượng Hoàng Bóng Tối. Tuy nhiên, sức mạnh mới không chỉ gây ảnh hưởng đến chính bản thân cô mà còn đe dọa đến mạng sống của những người khác. Nhóm X-Men lúc này phải đối mặt với một lựa chọn khó khăn: giữ lại Jean Grey hay chọn sự bình yên cho thế giới?