Biệt Đội Đánh Thuê sẽ bắt đầu một nhiệm vụ mới tại một nhà máy vũ khí hạt nhân cũ tại Qadhafi để tóm gọn Suharato Rahmat, kẻ đang âm mưu một mình đánh cắp kíp nổ hạt nhân cho gã khách hàng xảo quyệt Ocelot. Rahmat từng là một tay buôn vũ khí người Anh với đội quân của riêng mình. Hắn đã thành công đánh cắp va li chứa kíp nổ trước khi Biệt Đội Đánh Thuê kịp tìm đến. Nếu kíp nổ rơi vào tay Ocelot, gã sẽ hủy diệt cả thế giới. Sau khi nhiệm vụ tóm gọn Rahmat thất bại, cả đội tiếp tục hành trình trên con thuyền Jantara, nơi bước ngoặt thực sự của câu chuyện xảy ra, và một sự thật gây sốc về Ocelot được hé lộ.