Chuyển thể từ cuốn tiểu thuyết được yêu thích của mọi thời đại, 1 trong 100 cuốn sách có giá trị nhất thế giới, Khu Vườn Huyền Bí xoay quanh cô bé Mary Lennox chuyển đến nhà của người bác tại vùng nông thôn nước Anh sau khi bố mẹ qua đời. Tại đây, Mary tình cờ gặp gỡ chú chim ức đỏ và vô tình khám phá ra khu vườn bí mật đã bị đóng cửa nhiều năm trời. Cùng với cậu bạn Dickon, một cậu bé am hiểu về thiên nhiên và có thể nói chuyện được với các loài vật, Mary ngày ngày chăm sóc và hồi sinh khu vườn cổ tích lung linh với những điều kỳ diệu.